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2026년, 세금과 지원금의 판도가 바뀝니다. 우리 회사에 약이 될 정책과 독이 될 규제를 세무 전문가가 직접 짚어드립니다. 대표님의 이익을 극대화하고 리스크를 최소화할 핵심 전략을 지금 바로 확인하십시오!
세무법인동안 서초지점 대표 세무사 정용식입니다.
대표님, 2026년 사업 계획은 어떻게 세우고 계십니까? 매년 수없이 쏟아지는 정책 변화 속에서 우리 기업에 유리한 것은 무엇이고, 피해야 할 리스크는 무엇인지 옥석을 가리는 것은 경영자의 중요한 역량입니다.
단순히 제도가 바뀐다는 사실을 아는 것을 넘어, 그 변화가 우리 회사의 재무제표와 현금 흐름에 어떤 영향을 미칠지, 어떻게 하면 이를 성장의 기회로 활용하고 불필요한 세무 리스크를 막을 수 있을지 고민하셔야 할 때입니다.
오늘은 대표님의 ‘이익 극대화’와 ‘세무 리스크 최소화’ 관점에서, 2026년부터 달라지는 핵심 제도들을 세무 전문가의 시각으로 알기 쉽게 짚어드리겠습니다. 😊
1. 스타트업 대표님, 이제 ‘원스톱 지원센터’로 시간을 버십시오 ⏱️
2026년 상반기부터 전국 17개 창조경제혁신센터에 ‘스타트업 원스톱 지원센터’가 운영됩니다. 이는 단순히 행정 편의를 봐주는 곳이 아닙니다. 법률, 세무, 노무, 특허 등 초기 기업이 겪는 복합적인 문제를 한곳에서 해결할 수 있도록 지원하는, 일종의 ‘경영 리스크 관리 센터’입니다.
무엇이 유리합니까?
대표님이 직접 세무서, 노무법인, 변호사 사무실을 찾아다니며 썼던 귀중한 시간을 아껴 핵심 비즈니스에 집중할 수 있습니다. 특히 사업 초기에 놓치기 쉬운 세무 신고, 4대 보험, 정부 지원금 회계 처리 등의 문제를 전문가 상담을 통해 초기에 바로잡을 수 있습니다.
💡 세무사 Tip!
사업 초기의 세무 구조 설계가 향후 10년의 세금을 좌우합니다. 많은 대표님께서 초기 비용을 아끼기 위해 세무를 등한시하다가, 수년 뒤 가산세라는 더 큰 비용을 치르곤 합니다. 이 지원센터를 ‘비용 절감’이 아닌, 미래의 불필요한 지출을 막는 ‘최소한의 투자’라는 관점에서 적극 활용하시길 권합니다.
사업 초기의 세무 구조 설계가 향후 10년의 세금을 좌우합니다. 많은 대표님께서 초기 비용을 아끼기 위해 세무를 등한시하다가, 수년 뒤 가산세라는 더 큰 비용을 치르곤 합니다. 이 지원센터를 ‘비용 절감’이 아닌, 미래의 불필요한 지출을 막는 ‘최소한의 투자’라는 관점에서 적극 활용하시길 권합니다.
2. 기업부설연구소, ‘R&D 세액공제’ 혜택이 더 커집니다 🔬
2026년 2월부터 「기업부설연구소법」이 시행됩니다. 여러 법령에 흩어져 있던 연구소 관련 규정이 하나로 통합되어 정책의 예측 가능성과 안정성이 높아졌습니다.
핵심 변화는 무엇입니까?
- 연구 공간 활용 유연화: 칸막이 대신 이동식 파티션 활용이 가능해져 공간 활용도가 높아지고, 이는 임차료 등 고정비 절감으로 이어질 수 있습니다.
- 연구 전담 요원 인정 범위 확대: 이공계 석사 과정생이 국가 R&D 과제에 참여하면 연구 전담 요원으로 인정받게 됩니다. 이는 중소기업의 가장 큰 고민인 연구인력 확보에 숨통을 틔워주는 중요한 변화입니다.
💡 세무사 Tip!
R&D 세액공제의 핵심은 ‘인건비’와 ‘연구비’에 대한 증빙입니다. 특히 이번 법 시행으로 연구 전담 요원 인정 범위가 확대된 만큼, 개정된 요건에 맞춰 내부 인력을 재검토해 보십시오. 예상보다 더 큰 법인세 절감 효과를 얻을 수 있습니다. 이를 위해서는 연구개발 계획서, 연구노트 등 객관적인 증빙 자료를 평소에 꼼꼼히 관리하는 것이 세무조사 대비의 핵심입니다.
R&D 세액공제의 핵심은 ‘인건비’와 ‘연구비’에 대한 증빙입니다. 특히 이번 법 시행으로 연구 전담 요원 인정 범위가 확대된 만큼, 개정된 요건에 맞춰 내부 인력을 재검토해 보십시오. 예상보다 더 큰 법인세 절감 효과를 얻을 수 있습니다. 이를 위해서는 연구개발 계획서, 연구노트 등 객관적인 증빙 자료를 평소에 꼼꼼히 관리하는 것이 세무조사 대비의 핵심입니다.
3. 해외 직구 규제📦
2026년 6월부터 ‘자가사용 목적 직접구매 해외제품 안전관리 제도’가 시행됩니다. 소비자의 안전을 위해 위해성이 확인된 제품의 국내 반입을 차단하는 것이 골자입니다.
대표님께서는 무엇을 보셔야 합니까?
이 제도는 B2C에 초점이 맞춰져 있지만, 사업에 필요한 샘플, 부품, 소량의 원자재 등을 해외에서 직접구매(직구) 형태로 들여오는 기업에게는 예상치 못한 리스크가 될 수 있습니다. KC 인증 등이 없는 제품의 통관이 지연되거나 막힐 경우, 생산 계획 전체에 차질이 생길 수 있습니다.
⚠️ 주의하세요!
생산 차질로 인한 납기 지연은 세금 문제보다 훨씬 큰 손실(계약 파기, 손해배상 등)을 유발할 수 있습니다. 지금 바로 해외에서 직구하는 주요 품목 리스트를 점검하고, 통관 불가 리스크는 없는지 확인해야 합니다. 필요하다면 정식 수입 절차를 밟거나 대체 공급선을 미리 확보해두는 것이 안정적인 경영을 위한 현명한 대비책입니다.
생산 차질로 인한 납기 지연은 세금 문제보다 훨씬 큰 손실(계약 파기, 손해배상 등)을 유발할 수 있습니다. 지금 바로 해외에서 직구하는 주요 품목 리스트를 점검하고, 통관 불가 리스크는 없는지 확인해야 합니다. 필요하다면 정식 수입 절차를 밟거나 대체 공급선을 미리 확보해두는 것이 안정적인 경영을 위한 현명한 대비책입니다.
4. 해외 진출, ‘정부 지원금’으로 세무 리스크를 막으십시오 ✈️
2026년 2월부터 물류기업의 해외 진출을 돕는 컨설팅 지원이 대폭 확대됩니다. 타당성 조사 비용 한도가 1억에서 2억으로, 현지 법인 설립 및 M&A 컨설팅 비용도 4천만 원에서 5천만 원으로 늘어납니다.
이것이 왜 중요합니까?
해외 진출 시 가장 복잡하고 어려운 문제가 바로 현지 세법과 국제조세입니다. 많은 기업이 현지 세무 구조를 잘못 설계하여 막대한 세금을 추징당하거나, 이중과세 문제로 어려움을 겪습니다.
💡 세무사 Tip!
해외 세무 리스크는 ‘모르고 당하는’ 경우가 대부분입니다. 이번에 확대된 정부 지원금을 활용하여, 진출 초기 단계부터 현지 법률 및 세무 전문가의 자문을 받는 것을 적극 권장합니다. 이는 수십억 원의 세금 추징을 막는 가장 효과적이고 저렴한 투자가 될 것입니다.
해외 세무 리스크는 ‘모르고 당하는’ 경우가 대부분입니다. 이번에 확대된 정부 지원금을 활용하여, 진출 초기 단계부터 현지 법률 및 세무 전문가의 자문을 받는 것을 적극 권장합니다. 이는 수십억 원의 세금 추징을 막는 가장 효과적이고 저렴한 투자가 될 것입니다.
5. 물류비, ‘스마트 물류센터’로 고정비를 변동비로 바꾸십시오 🚚
2026년 3월, 인천항에 ‘스마트 공동물류센터’가 본격적으로 문을 엽니다. 로봇, AI 등 최첨단 기술이 집약된 이곳을 중소기업도 저렴한 비용으로 이용할 수 있게 됩니다.
재무적 관점에서의 이점은 무엇입니까?
직접 물류창고를 짓거나 임차하는 막대한 초기 투자 비용과 매달 나가는 고정 임차료를, 물동량에 따라 비용을 지불하는 ‘변동비’로 전환할 수 있습니다. 이는 기업의 현금 흐름을 극적으로 개선하고, 재무제표를 훨씬 건강하게 만들어 줍니다.
💡 세무사 Tip!
절감된 고정비는 기업의 이익잉여금을 늘리는 효과를 가져옵니다. 탄탄한 이익잉여금과 개선된 현금 흐름은 재무 건전성 지표를 높여, 향후 금융기관 대출이나 정책자금 신청, 투자 유치 시 매우 유리한 평가를 받는 기반이 됩니다.
절감된 고정비는 기업의 이익잉여금을 늘리는 효과를 가져옵니다. 탄탄한 이익잉여금과 개선된 현금 흐름은 재무 건전성 지표를 높여, 향후 금융기관 대출이나 정책자금 신청, 투자 유치 시 매우 유리한 평가를 받는 기반이 됩니다.
6. 기술 기반 기업이라면, ‘공공구매 시장’을 적극 활용하십시오 🏛️
2026년 1월부터 중소기업의 혁신제품에 대한 공공구매가 확대됩니다. 특히 AI, 기후테크 등 신산업 분야 제품을 집중 발굴하고, 관련 예산도 354억 원에서 624억 원으로 대폭 증액되었습니다.
왜 이것이 좋은 기회입니까?
기술력은 있지만 판로 개척에 어려움을 겪는 기업에게 ‘안정적인 초기 매출’을 확보할 기회를 제공합니다. 공공기관 납품 실적(레퍼런스)은 그 자체로 기술력과 신뢰도를 입증하는 보증수표가 되어 민간 시장 진출의 강력한 발판이 됩니다.
마무리: 정책의 변화는 위기이자 기회입니다 📝
중요한 것은 이 변화의 흐름을 읽고, 우리 기업에 가장 유리한 방향으로 해석하고 적용하는 ‘전략’입니다.
세무법인동안 서초지점은 단순히 숫자를 기록하고 신고를 대리하는 곳이 아닙니다. 대표님의 사업이 더 크게 성장하고 단단해질 수 있도록, 재무와 세무 관점에서 가장 유리한 길을 함께 고민하는 비즈니스 파트너입니다.
오늘 짚어드린 내용 외에도 궁금한 점이 있으시다면, 언제든 편하게 문을 두드려 주십시오. 대표님의 곁에서 가장 든든한 조력자가 되어 드리겠습니다. 궁금한 점은 댓글로 물어봐주세요~ 😊
세무법인동안 서초지점
대표 세무사 정용식 드림.
2026년 경영 핵심 체크리스트
✨ 스타트업 지원: 원스톱 지원센터로 법률/세무 리스크를 초기에 관리하세요.
🔬 R&D 세액공제: 확대된 연구인력 요건을 활용해 법인세를 절감하세요.
📦 원자재 수급 리스크: 해외 직구 품목의 통관 리스크를 점검하고 대비하세요.
✈️ 해외 진출 지원: 정부 지원 컨설팅으로 현지 세무 리스크를 최소화하세요.
🚚 물류비 절감: 스마트 물류센터로 고정비를 변동비로 전환해 현금흐름을 개선하세요.
🏛️ 공공구매 활용: 혁신제품 공공구매로 안정적인 초기 매출과 레퍼런스를 확보하세요.
자주 묻는 질문 ❓
Q: ‘스타트업 원스톱 지원센터’의 상담은 유료인가요?
A: 기본적인 상담은 무료 또는 매우 저렴한 비용으로 제공될 가능성이 높습니다. 정부 지원 사업의 일환이기 때문입니다. 다만, 심층적인 자문이나 실제 업무 대행에는 별도 비용이 발생할 수 있으니, 방문 전 해당 센터에 문의하시는 것이 가장 정확합니다.
Q: R&D 세액공제를 받으려면 구체적으로 어떤 서류를 준비해야 하나요?
A: 가장 중요한 것은 ‘연구 활동’을 객관적으로 증빙하는 것입니다. 필수 서류로는 연구개발계획서, 연구개발보고서, 연구노트 등이 있으며, 연구인력의 인건비 증빙자료(급여대장, 원천징수이행상황신고서 등)와 연구비 사용 내역(세금계산서, 계좌이체 내역 등)을 꼼꼼히 챙겨야 합니다.
Q: 해외 직구 규제는 저희가 사업용으로 소량 수입하는 모든 부품에 적용되나요?
A: 정부가 발표하는 ‘위해성 확인 제품’ 리스트에 포함되는 품목이 직접적인 규제 대상입니다. 따라서 모든 품목에 적용되는 것은 아닙니다. 하지만 어떤 제품이 리스트에 추가될지 예측하기 어려우므로, 핵심 부품이나 원자재는 지금부터라도 정식 수입 절차를 검토하거나 국내 대체 공급선을 확보하는 등 리스크 관리가 필요합니다.
Q: 인천항 ‘스마트 공동물류센터’는 아무 기업이나 이용할 수 있나요?
A: 주로 중소·중견기업의 수출입 물류 지원을 목적으로 설립되었기 때문에, 해당 기업들이 우선적인 이용 대상이 될 것입니다. 구체적인 이용 자격, 절차, 비용 등은 정식 개장 시점에 발표될 운영 지침을 확인해야 합니다. 관련 공고를 주시하시는 것이 좋습니다.
Q: 저희도 ‘혁신제품 공공구매’에 참여하고 싶은데, 자격 요건이 어떻게 되나요?
A: 일반적으로 중소기업이 개발한 기술개발제품 중 기술의 혁신성과 공공성이 인정된 제품이 대상이 됩니다. ‘혁신제품’으로 지정받기 위한 별도의 신청 및 심사 절차가 있으며, 중소벤처기업부나 조달청 등 관련 기관의 공고를 통해 구체적인 자격 요건과 신청 방법을 확인하실 수 있습니다.